【選擇基因組測序物種的方法】迄今已被測序的細菌和古細菌基因組之所以被選擇測序,主要是考慮到它們的生理問題 。這種選擇依據并沒錯,但卻導致了明顯的系統發育偏頗 。在“細菌和古細菌基因組百科全書”(GEBA)項目中,研究人員采用了另一種方法,該方法主張根據生物的系統發育位置來選擇基因組,其目的是填補在生命樹的細菌和古細菌分支測序中的空白 。這一方法的價值已被一項示范研究的成果證實,即選擇用來擴大系統發育覆蓋面的56個可培育物種基因組序列的發布 。對這些序列進行分析,可提供系統發育、蛋白功能和基因組注解等方面的信息 。
作者:田天
來源:科學時報
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