茶樹多酚氧化酶基因的SNP分析

選取有代表性的40個茶樹品種(系)為材料,先采用PCR-SSCP-銀染檢測技術,對供試材料的多酚氧化酶(PPO)基因進行SSCP分析,對PPO基因作初步基因分型;根據分型分析結果,對每一類型選擇典型品種的PPO基因作進一步的DNA序列分析,用DNASTAR Program 進行單核苷酸多態性(SNP)搜尋.結果表明,茶樹PPO基因存在豐富的SNP,其類型包括:轉換(A←→G,C←→T)、顛換(A←→T,G←→C,G→T,A→C)與雜合子(C/T,A/G,G/T,A/T,A/C,G/C).在發現的37個SNPs中,有13個SNPs發生在核酸內切酶酶切位點,有10個錯義SNPs位點導致氨基酸的改變.在PPO基因的保守序列區,出現SNP的頻率較低.【茶樹多酚氧化酶基因的SNP分析】完成機構:[1]湖南農業大學,茶學教育部重點實驗室,湖南長沙410128 [2]廣東省農業科學院,茶葉研究所,廣東英德513042

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