乳酸菌是原核生物，原核生物是指一類細胞核無核膜包裹，只有稱作核區的裸露DNA的原始單細胞生物 。它們都是單細胞原核生物，結構簡單，沒有細胞器結構，個體微小 。它包括細菌、放線菌、藍細菌和古細菌等 。乳酸菌呈桿形，本來叫乳酸桿菌，通常省略“桿”字，所以乳酸菌屬于細菌，屬于原核生物 。
乳酸菌不僅是研究分類、生化、遺傳、分子生物學和基因工程的理想材料（在理論上具有重要的學術價值），而且在工業、農牧業、食品和醫藥等與人類生活密切相關的重要領域具有極高的應用價值 。
【乳酸菌是真核還是原核】乳酸菌是一種益生菌，其能夠將碳水化合物發酵成乳酸，因而得名 。乳酸菌分布廣泛，通常存在于肉、乳和蔬菜等食品及其制品中 。此外，乳酸菌也廣泛存在于畜、禽腸道及少數臨床樣品中，其中，在人類和其他哺乳動物的口腔、腸道等環境中的乳酸菌，是構成特定區域正常微生物菌群的重要成員 。

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